Pracovníci ÚDMP se aktivně podílejí na pregraduální výuce zejména na 1. lékařské fakultě UK. Participují však rovněž na výuce a vedení studentů i na dalších pražských vysokých školách (VŠCHT, PřF UK, 2. a 3. LF UK).
V rámci výuky magisterských studijních programů na 1. LF UK je pracoviště garantem nebo spolugarantem těchto předmětů:
Molekulární medicína a biotechnologie
Praktický kurs konfokální mikroskopie (v současnosti není vuyčován)
Kurz buněčných kultur s aplikací pro studium dědičných metabolických poruch
Praktický kurs Aplikace technologií DNA čipů v diagnosite geneticky podmíněných onemocnění
Praktický kurs Příprava rekombinantních proteinů jako podklad pro strukturální biologii
Dále se pracovníci ÚDMP podílí na výuce předmětů
Klinická biochemie
Laboratorní technika 1 - 4
Současné metody v buněčné biologii
Většina těchto kursů je vyučována jak v českém tak v anglickém jazyce.
Pedagogové se rovněž významně podílí na vedení magisterských diplomových prací, zejména z Fakulty potravinářské a biochemické technologie VŠCHT a Přírodovědecké fakulty UK, jakož i z ostatních pražských lékařských fakult.